La fundacion se realizo en la alameda de Santa Clara en 1558, intervinieron en la arquitectura alarifes y canteros mestizos, indios y el arquitecto Fray Manuel Pablo, quien dio termino a la obra.
Cuenta con un formidable altar mayor y retablo con espejos venecianos, constituyendo la unica muestra de este estilo en el Cusco, fue construido por Pedro de Oquendo.